Der „Port of Cebu“ ist der größte Binnenhafen der Philippinen. Er liegt in Cebu City und versorgt das gesamte Metro-Cebu Gebiet. U.a. verfügt er über ein knapp 2'700 m2 grosses, vollklimatisiertes Terminal mit einer freigiebigen Lobby mit Wi-Fi-Internetverbindung. Verwaltet wird der Hafen von der Cebu Port Authority.
 
Eine Vielzahl von Reedereien bedienen im Passagierverkehr vor allem Strecken innerhalb der Visayas und nach Mindanao. Daneben verkehren zahlreiche RoRo-Fähren (Roll-On, Roll-Off) für den Auto-/ Lastenwagentransport.